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单细胞分析代码去哪可以找到?

单细胞分析代码去哪可以找到?

引言在本指南中,将介绍如何利用Cicero工具和单细胞ATAC-seq数据来识别共可接近网络。 为了在Seurat(Signac工具使用的格式)和CellDataSet(Cicero工具使用的格式)之间轻松转换数据,将利用GitHub上的SeuratWrappers包提供的转换功能。 数据加载将采用Satpathy和Granja等人在2019年发表在《Nature Biotechnology》上的研究成果,使用他们发布的包含人类CD34+造血干细胞和祖细胞的单细胞ATAC-seq数据集。这些经过处理的数据可以…