《咒术回战》到底讲了一个什么样的故事？
大概就是说，因为人类的嫉妒、悔恨、耻辱、痛苦等负面情绪，逐渐诞生了诅咒，形成了咒力，而咒力又形成了各种叫做咒灵的怪物，会给人类带来灾难，导致人类的死亡。而可以利用咒力来对抗咒灵的人类，被称为“咒术师”。
后来，咒术师学会使用了各种咒力的术式，并用咒力制作出咒具和有意识的人偶咒骸，自己创造出来咒灵帮助自己叫做式神，用来帮助自己战斗。并通过术式操控咒力发明了在周围构筑的领域和领域展开，在领域内命中率会达到百分百，咒力强大的咒术师可以学会领域展开。根据咒力的强弱，将咒灵和咒术师分为了特级、一级、二级、三级四个等级。
一千年前，一位不死的女咒术师天元出现，并通过不死术式化为结界守护着日本的国土，但他需要定期将特殊体质的普通人作为星浆体献祭生命与自己同化，才能维持作为人类形态否则将会变成咒灵。而信奉天元的普通人则因此成立了盘星教。当时日本咒术界出现了三大家族藤原家 安倍家 菅原家，三个家族的家主也是最强三个咒术师。
同时这个时期，芦屋贞纲创建了新的剑术流派-新阴流，这种剑术流派强调速度和灵活性，通过快速的剑击和灵活的身法来攻击敌人。以及可以中和敌方领域的简易领域，用咒力构建起一个属于自己的结界，在敌方领域展开时，能够起到保护作用。后来逐渐增加门生形成了能与三大家族对抗的力量。
后来，一对在母胎中的双胞胎，哥哥为了活下去在胎中吃掉了弟弟并诞生，因此他拥有两条手臂两张脸两个嘴巴而被人们视为不详。长大后他成为了当时最强的咒术师，人们称他为“两面宿傩”。安倍家主晴明看出两面宿傩为灾祸便派天使咒术师去消灭他。结果宿傩歼灭了天使和三大家族的精英部队藤原家的日月星进队和五虚将以及安倍家和菅原家联军的捏漆镇抚队，整个咒术界都没有成功讨伐他，他也因此成为诅咒之王。
因为两面宿傩成为最强所以被请入平安京宫中参加“新尝祭”被人们像神一样礼拜、供奉和祈祷，可孤独的宿傩早已变得冷漠无情根本不在意这些普通人，只有冰系咒术师里梅因为做饭好吃而被宿傩留在了身边做部下。女特级咒术师“万”则因为宿傩的强大而爱上了他，主动去勾搭宿傩并直接抱住了他，并说要取代里梅的位置，让宿傩再不会露出这种孤独的表情，最后被无情的宿傩一击斩杀。后来，宿傩去世时身体被可以把灵魂封印入肉体的咒术师羂索做成了咒物，将他的手指切成20根封印到了日本各地。里梅则用术式冰封了自己，等待宿傩的复活。
羂索的目的是想让全人类都得到进化，进化成一种介于人与咒灵之间、拥有强大咒力且受他操控的全新形态，因此想让人类都与天元同化。而完成这个目标就要借助宿傩的力量，为了后面复活宿傩并创造出来宿傩复活的容器，他将宿傩双胞胎弟弟的灵魂保存了下来并不断转世。
他的术式是通过移植自己大脑和别人更换身体，因此靠这种方式一直存活了下去，千年来不断更换身体和身份。并且在千年间与各个时代的强大咒术师签订了契约，答应未来使用术式将他们复活，为了后面复活他们用来完成自己的目标。
后来日本出现了新的三大家族即五条家、禅院家和加茂家。五条家的术式为无下限术式，能让接近使用者的人的速度变慢并无限接近于零，使其看起来像是时间停止。并可以发动术式正转“苍”进行吸引反应，使空间内多个东西被吸引到一起，发生碰撞甚至爆炸，以及术式反转“赫”将空间内的东西向外排斥，并可以将苍和赫相互碰撞结合为虚构质量，发动拥有切割空间力量的虚式“茈”。且五条家每隔几百年就会出现一个拥有特殊之眼“六眼”的人，六眼可以进行360度视野的咒力感知，看穿咒力流动和咒术师的术式，也因此提升了术式使咒力消耗几乎为零。
同时五条家也是菅原家的后代。而禅院家的术式主要为十种影法术，以影子作为空间，储存各种式神，但需要对式神进行降服才能使用，其中最强的式神为魔虚罗，拥有可以适应所有攻击的能力，被它看见过一次的招式第二次很难产生效果，因此禅院家至今无人降服这个式神。而加茂家的术式则是赤血操术，通过操控血液进行攻击。比如将血液压缩至极限凝聚到一点喷射而出，喷射初速度可达到音速，叫做“穿血”，以及将血液凝固成刀状进行切割叫做“血刃”。
四百年前，拥有六眼的五条家主曾与禅院家主进行过一场大战，禅院家主最终召唤了魔虚罗与五条家主同归于尽，直到28年前五条家新的六眼拥有者五条悟才再次降世。150年前，羂索用术式夺舍了加茂家家主加茂宪伦的身体，他为了创造出非人类非咒灵的新物种，便让一位拥有特殊体质可以怀咒灵孩子的人类女子与咒灵诞下九个咒胎，并在其中混入了自己的血，使其成为了特级咒物咒胎九相图，即胀相、坏相、血涂、脓烂相、青相、噉相、散相、骨相、烧相，他们九个咒灵与人类结合体因此拥有加茂家血脉也可以使用赤血操术。再后来羂索又夺舍了宿傩弟弟的转世虎杖仁的妻子香织，与虎杖仁生下了这部剧的男主角虎杖悠仁作为宿傩复活的容器，也是两面宿傩的侄子。
千年后，咒术界创建了培养咒术师的咒术高专，拥有潜力的学生都来到高专进行学习，成为咒术师执行任务祓除咒灵，而咒术高专东京校区也成为了天元的藏身地。东京校区的校长为夜蛾正道，是会制作咒骸的咒术师。而五条家拥有六眼的五条悟也来到了高专学习，和拥有咒灵操术的夏油杰、能用反转术式治疗身体的女咒术师家入硝子成为同届同学。五条悟和夏油杰因为实力强大，成为了咒术界仅有的三个特级咒术师中的两个，两人共同执行任务祓除咒灵成为了挚友。但此时的五条悟的力量还未觉醒，只学会了术式中的正转术式“苍”。
12年前，天元因为要与星奖体同化，便派去五条悟和夏油杰去寻找女星奖体天内理子保护她并带回高专。盘星教因为觉得天元是神不应该与人类同化，让人类身体玷污天元，便派去众多咒术师去追杀天内理子，都被两人一一打败。最后他们派去了人类战力的天花板禅院家的禅院甚尔。
禅院甚尔因为天生的天与咒缚失去咒力从而换取强大的肉体能力和五感，而被看重咒力的禅院家嘲讽和虐待、抛弃，将幼年的甚尔丢入咒灵群中自生自灭，嘴角也因此留下伤疤。后来甚尔脱离禅院家并入赘伏黑家，改姓伏黑，憎恨禅院家并变得特别冷酷。在两任妻子去世后便抛下了两个孩子靠杀咒术师成为了赏金猎人，并将自己拥有咒力的儿子伏黑惠卖给禅院家。他为了证明没有咒力也能打败强大的咒术师，便接下了刺杀天内理子的任务去挑战六眼拥有者五条悟。他虽无咒力却有着三节棍“游云”、能强制解除发动中术式的天逆鉾、无视物体硬度直击魂魄的释魂刀等强大咒具。
因为甚尔没有咒力，只有咒具和收纳咒具的咒灵丑宝，所以五条悟的六眼感知不到咒力，而被身体速度极快的甚尔一刀刺入脖子杀死。临死状态下五条悟领悟了反转术式救回了自己，并提升了无下限术式学会术式反转的招式“赫”。
随后，甚尔进入天元所在的薨星宫，枪杀了夏油杰身旁的天内理子，夏油杰也召唤虹龙等强大咒灵和甚尔对决。最后高硬度的虹龙被甚尔用释魂刀在空中砍成两半，夏油杰想趁机吸收他的武器库咒灵丑宝失败被砍成重伤。就在甚尔以为任务完成时，本该死去却复活的五条悟却突然再次出现，变强后的五条悟使用术式正转“苍”和反转“赫”结合的大招虚式“茈”击杀了甚尔。甚尔临死前将自己卖给禅院家的儿子伏黑惠托付给了五条悟。
天元因此次事件同化失败逐渐咒灵化，并开始渐渐可以同化普通人，使得羂索的计划可以成功执行，一个没有咒力的肉体最强伏黑甚尔成功对咒术界的命运造成了极大的改变。后来五条悟又学会了领域展开，获得能用精神控制让别人无法动弹的领域“无量空处”。五条悟经此一战觉醒了术式成为了现代最强咒术师，开始独自执行任务，让夏油杰觉得孤独和自己不够强，开始产生自我怀疑。而女特级咒术师九十九由基则开始给他灌输只要人类像甚尔那样没有咒力，或者让所有人类都学会控制咒力都成为咒术师，就会让咒灵消失的思想。夏油杰因此萌生了杀光所有能产生诅咒的普通人类只留下咒术师的想法。
之后，因为咒术师同伴在讨伐咒灵时的牺牲，外加夏油杰在出任务时看到一对双胞胎小女孩只因为有咒力就被村民囚禁并故意冤枉。夏油杰看到了人类的丑恶，认为咒术师为什么要用生命保护这些丑恶的普通人，正是因为他们的丑恶诞生了咒灵害死了咒术师。夏油杰便彻底黑化厌恶人类屠杀了整个村子，并离开高专开始了极端的人类屠杀之路，开始收集各种强大的咒灵，并成为了盘星教的首领，利用教主身份获得普通人的咒灵和金钱，骗光有钱人的钱后就会杀死他们。夏油杰也因此受到了高专的通缉，成为高专的敌人。最强两个咒术师曾经的挚友至此开始成为敌人。同时甚尔死后夏油杰拿走了他的咒具游云并吸收了他的咒灵丑宝。
菅原家与藤原家的后代乙骨忧太，天生拥有强大的咒力与天赋成为最年轻的第四个特级咒术师。他小时候与一位叫祈本里香的女生成为童年玩伴，里香渐渐的喜欢上了忧太，并送了他一枚戒指与他约定长大后后要嫁给他。可之后的一天，里香突然出了车祸而死，无法接受里香死亡的忧太无意识中用自己的咒力诅咒了里香，里香因此变成了一只特级咒灵并一直陪伴守护在自己身边。因为爱是最扭曲的诅咒。但忧太却一直以为是里香诅咒了自己。之后，学校有人欺负忧太，里香就会作为特级咒灵出现杀掉他们。因此一年前16岁的乙骨忧太被咒术界给盯上，派五条悟对乙骨忧太进行死刑。
可五条悟却无视上层命令保住了乙骨忧太，并把他带到高专进行学习，教会他控制里香的力量。忧太在高专与咒言师狗卷棘、咒骸熊猫、禅院家没有咒力的女孩禅院真希成为了同学，三人一起执行任务祓除咒灵。在一次执行任务时为了救人不得已召唤了里香打败咒灵，里香的强大因此被夏油杰盯上，想要吸收里香为己所用。之后，夏油杰对高专发动挑战，分别放一千只咒灵到东京和京都来拖住咒术界的力量，让咒灵们见人就杀。自己则乘虚而入来到高专吸收里香。
夏油杰使用咒灵与熊猫、狗卷棘、真希展开战斗，最后将他们打成了重伤。紧接着，夏油杰使用咒具游云和赶来的乙骨忧太展开了决战，最后不敌乙骨忧太便使用了自己的终极大招将几千只咒灵融合的极之番·漩涡。忧太为了保护大家，表白了已是咒灵形态的里香并吻了他，说要把自己一切献给里香，只要打赢了夏油杰就和她走，这样他们就能永远在一起了。因此让一直爱着自己的里香给自己力量解除了咒力限制，从而发动力量与夏油杰的极之番对抗。夏油杰说他是玩弄感情的渣男，乙骨忧太则回复“真是无礼，我们可是纯爱”最终打败了夏油杰。重伤的夏油杰最终被曾经的挚友五条悟无奈的亲手杀死。
而乙骨忧太也经过此次事件明白了一直以来其实是自己诅咒了里香，而不是里香诅咒了自己，最后成功解除了对里香的诅咒，里香的咒灵最终消散，不过后来乙骨通过术式重新创建了和里香一样的的式神。乙骨忧太在这之后被五条悟派去了非洲执行任务，并学会了反转术式和复制术式可以复制模仿任何人的术式，并拥有了超过五条悟的无限咒力。并学会了和狗卷一样使用咒言，即通过语言念咒语来施加咒力产生各种效果。
夏油杰死后，羂索看中了他可以吸收并操控咒灵的咒灵操术，便夺舍了他的尸体成为自己新的身份，并开始了自己让人类与天元同化和复活宿傩的计划。宿傩的容器虎杖悠仁也在今年因一次偶然为了救人吃下了宿傩的手指，从而让宿傩寄宿到了他的体内获得宿傩的力量，但宿傩无法长时间操控虎杖的身体，且宿傩因为只有一根手指所以只有原来力量的20分之一。就这样千年前的诅咒之王最强咒术师两面宿傩在容器的寄宿下再次复活。因此虎杖悠仁也被咒术界高层盯上，派五条悟对他进行死刑，然后五条悟就又保住了虎杖悠仁，并让他也来到高专学习，和禅院甚尔儿子伏黑惠、女咒术师钉崎野蔷薇成为了同届同学。
因为五条悟不想因为乙骨和虎杖他们这些年轻咒术师身上拥有无法控制的强大力量，就将他们杀死。反而想要将他们带到高专成为自己的学生指导他们如何控制力量。且五条悟看不惯咒术高层的一些自私并害人的做法，一直与他们对着干，想要通过教育出乙骨虎杖伏黑他们这些年轻的咒术师改变咒术界，高层也因为五条悟的强大没办法把他怎么样。
虎杖悠仁则在后来一次次吃下好多根宿傩的手指，让两面宿傩渐渐的恢复力量，三人一起执行任务祓除咒灵，和二年级学长狗卷棘、熊猫、真希一起参加与京都校的交流会，结识了京都校的东堂葵、女新阴流使用者三轮霞、拥有天与咒缚的机械丸操控者与幸吉、加茂家的加茂宪纪、拥有构筑术式的真希妹妹真依、女咒术师西宫桃。
虎杖在交流会与京都校能够进行位置互换术式的咒术师东堂葵成为了好兄弟，后来多次通过位置互换进行配合一起战斗，并联手打败了特级咒灵。在东堂葵的指导下，虎杖学会了黑闪。黑闪就是一种当打击与咒力冲击之间的误差在0.000001秒内时所产生的空间扭曲现象。其威力平均为通常的2.5次方。但打出的概率很低。
羂索则在宿傩复活后开始和特级咒灵真人、漏壶、花御、陀艮一起执行计划，准备用咒物狱门疆封印现代最强咒术师五条悟。一次次开始袭击五条悟和高专的咒术师，并趁交流会期间偷走了高专保管的六根宿傩手指和咒胎九相图的胀相、坏相、血涂，并让三个人类咒灵结合体诞生。
因为羂索在千年间败给了两次五条家的六眼拥有者，且每次都惨败，即使杀死五条悟也会诞生新的拥有六眼的强者，所以只能封印五条悟。羂索也将千年间签约的各种强大咒术师灵魂对很多普通人进行诅咒，他们在被诅咒后就一直昏迷不醒，其中包括伏黑惠的姐姐津美纪。
五条悟请来了一级咒术师七海建人当虎杖悠仁的导师，两人一起遇到了特级咒灵真人，真人的术式无为转变可以触及人类的灵魂将人类变成咒灵，非常危险。两人虽然曾打败了真人却无法将真人彻底杀死，因为真人的灵魂很隐蔽普通人无法伤到他的灵魂只能让他肉体暂时受损，只有拥有宿傩力量的虎杖能够直击他的灵魂，且真人拥有领域“自闭圆顿裹”实力很强。因此在后来的对战中众多咒术师都被真人杀死。而宿傩则看中了伏黑惠能适应他的身体和他能召唤最强式神魔虚罗的十种影法术，想要转去夺舍伏黑惠。
虎杖悠仁在一次任务中结识了朋友吉野顺平。顺平从小是跟着母亲的单亲家庭，且因为性格懦弱在学校被欺负，额头上被同学伤害留下了疤痕，他便用刘海遮住了半边脸。真人便帮他杀害了欺负他的几名同学，并向他解释了咒术界，展示了自己把人类变成咒灵的实验。真人利用他内心的负面情绪蛊惑顺平，获得了他的信任，并教会了他使用咒力并获得了水母式神淀月。
之后，真人却利用咒灵杀害了顺平的母亲，并骗他是他同学所为，愤怒的顺平来到学校使用咒力复仇。就在顺平准备杀人时虎杖赶到，与顺平和他的式神淀月展开决战。虎杖劝说他加入高专寻找真正的凶手。就在这时真人出现，顺平表示真人是好人，却突然想起自己曾见到的实验品，意识到真人就是真凶。真人便使用无为转变将顺平变成了咒灵攻击虎杖，不忍心杀害朋友的虎杖无奈向宿傩求助却遭到宿傩嘲笑。最终变成咒灵的顺平还是倒地而死。这件事也深深打击了虎杖悠仁，让他对真人产下仇恨
之后因为伏黑的姐姐津美纪曾来到八十八桥后便被羂索诅咒而昏迷不醒，外加最近很多人在这里遇害。于是三人来到这里调查，结果遇到了羂索埋设好的特级咒灵和咒胎九相图，伏黑惠使用十种影法术召唤式神对抗这只特级咒灵，虎杖和钉崎则对上了咒胎九相图的血涂和坏相，并以为他俩是咒灵。
伏黑惠最后陷入苦战差点被杀，关键时刻想起了五条悟的教导，从而觉醒力量学会了领域展开“嵌合暗翳庭”，最终击杀了特级咒灵。虎杖和钉崎则与血涂和坏相展开决战。钉崎野蔷薇的术式是“刍灵咒法”，这是一种类似于诅咒的攻击，可以用钉子扎别人血液或者身体部位，对别人灵魂进行诅咒攻击。最后虎杖钉崎联手成功击杀了他俩，却发现他俩并不是咒灵。
羂索和真人也在咒术高专安插了给他们提供情报的卧底，就是京都校的机械丸操控者与幸吉。与幸吉因为天与咒缚天生无法使用肉体，但却换来了极强的咒力，因此常年绷带包裹全身在远程驾驶机甲机械丸使用咒力进行战斗。而真人则以用自己术式治好他的身体为由而收买了机械丸，实际上机械丸是假装叛变等治疗好身体后就把封印五条悟的计划告诉五条悟，再去和自己喜欢的人三轮霞在一起。
真人使用术式治好了与幸吉后想要杀死他，与幸吉便召唤自己秘密研发的超大型机甲“究极机械丸试作0号”与真人大战。究极机械丸试作0号虽然战力很强，也成功击伤了真人的灵魂，但与幸吉一个一级咒术师终究不敌羂索和真人两个特级而失败被杀。但与幸吉仍然通过残留的意识通过小型机器将羂索的阴谋告诉了虎杖等人，并向三轮霞表白。
最后羂索派特级咒灵漏壶和花御在涉谷车站拖住五条悟，随后使用夏油杰的身体出现在五条悟面前，五条悟因为看到突然复活的曾经的挚友，无数曾经的回忆画面浮现在脑海中而愣住，因此成功被狱门疆封印。紧接着，知道五条悟被封印消息的高专众人赶去支援抢夺羂索的狱门疆，一路上各种邪恶的咒术师和羂索手下的咒灵来阻拦，因为最强咒术师五条悟被封印曾经藏起来的非高专邪恶咒术师都出来了。
虎杖对上了九相图的大哥胀相，因为虎杖曾杀了他两个弟弟另外两个九相图，所以胀相来找虎杖寻仇。最终胀相虽然使用赤血操术打倒了虎杖，却因为虎杖身上的气息发现他和自己有血缘关系，虎杖也是自己的弟弟便陷入了沉思。因为虎杖的妈妈和胀相的爸爸都是羂索，所以两人是异父异母的亲兄弟。
另一边，一位降灵师老奶奶尾神婆婆觊觎伏黑甚尔曾经那无敌的肉体能力，便召唤甚尔的身体并附身到自己孙子身上，但由于甚尔的身体实在太过强大，直接占据了他孙子的身体和灵魂。就这样，曾经的天与暴君伏黑甚尔时隔12年再次复活。复活的甚尔进入意识失控只会朝强者进攻的疯狂状态，直接击杀了召唤他的尾神婆婆，并不停向强者发起挑战。
伏黑惠则和禅院家主禅院直毘人、禅院真希、七海建人遇到了特级咒灵陀艮，被陀艮使用领域展开带入了领域，陷入苦战差点被团灭。就在这时，甚尔闯入领域直接击杀了陀艮，解除了领域。随后甚尔便向众人中最强者伏黑惠发起进攻，一场父子之战展开。由于甚尔太过强大，且伏黑惠咒力不够无法领域展开。伏黑惠只能用一群兔子式神拖住甚尔，并不断用飞行式神鵺和青蛙式神躲避和逃窜。就在伏黑惠受伤坚持不住时，甚尔突然认出眼前的人是自己的孩子而恢复了理智，便问他姓什么，伏黑惠回答“伏黑”，甚尔说“不是禅院吗，真好啊”。再度复活的伏黑甚尔很开心自己的孩子没有姓禅院，随后怕自己失控便拿刀刺向自己大脑自杀。而伏黑惠到他死时也没有认出眼前男人是曾经抛弃了他，并将年幼的他卖给禅院家的父亲。
另一边，特级火系咒灵漏壶出现用火焰杀掉了禅院直毘人，烧伤禅院真希和七海建人，倒下的虎杖悠仁又被漏壶喂下了好几根宿傩的手指，拥有15根手指力量的两面宿傩现身。漏壶向两面宿傩发起了挑战。因为漏壶一直很渴望力量并觉得自己很强，他觉得人类很弱小且充满各种负面情绪，想要咒灵成为世界的主宰而清除人类，所以就和羂索和真人混在了一起，且不断向五条悟和两面宿傩这种强者发动挑战来证明自己。
漏壶使用火焰术式与宿傩展开大战，却不敌宿傩。最后漏壶使用大招极之番·陨，一颗巨大火球砸向两面宿傩，最后宿傩却安然无养。随后，宿傩也使用了自己的火焰术式“开”进行反击，最后击杀了漏壶。临死前宿傩夸赞漏壶“千年间和我战斗过的人很多，你算是不错的，自豪吧，你很强”，漏壶被感动到流着泪被烧死。
紧接着，本就受伤的伏黑惠被邪恶咒术师偷袭重伤濒死，情急之下伏黑惠召唤未降服的禅院家最强式神魔虚罗，开启降服仪式打算和对方同归于尽。随后，宿傩找到了伏黑惠，发现他濒死并召唤了魔虚罗降服仪式，不打败魔虚罗就无法结束仪式，于是宿傩便和魔虚罗大战。最后宿傩成功打败魔虚罗解救了伏黑惠，并把伏黑惠送到了家入硝子那治疗。宿傩在打魔虚罗时开启空间斩，切割了几百米内的空间，导致大量高楼和地铁被破坏平民死伤众多。醒来后的虎杖也因为这个事自责，觉得自己是杀人犯。
另一边真人则杀掉了钉崎野蔷薇和七海建人，钉崎濒死状态下被带走治疗一直昏迷不醒，虎杖悠仁最后赶到却因为实力差距被真人打出黑闪击败。因为宿傩用虎杖身体杀害了很多人，钉崎和七海也被真人杀害而给虎杖带来了很大的打击。虎杖因此一蹶不振，好在赶来的东堂唤醒了虎杖。虎杖悠仁和东堂葵合力利用位置互换对战真人，东堂葵被真人砍掉了一只手臂失去术式功能，而真人则觉醒为了最终形态。最后虎杖成功打出黑闪彻底击败了最终形态的真人，陷入绝境的真人随后被赶来的羂索用咒灵操术吸收。
众人赶来一起对抗羂索却不是对手，胀相也在此时意识到了伪夏油杰就是玩弄他母亲的加茂宪伦，并当众揭穿了他的身份。羂索却让他和血涂、坏相杀害自己弟弟虎杖，让他们兄弟相杀，从而和高专开始一起对抗羂索。愤怒的胀相使用赤血操术和羂索展开了大战。就在这时，宿傩的部下里梅出现，趁机使用术式冰冻了高专所有人。随后，女特级咒术师九十九由基带着她的式神“迦楼罗”赶到，和羂索进行对峙。
最后，羂索用真人的术式无为转变解除了日本所有体内有古代咒术师灵魂被诅咒的人类的封印，让众多像宿傩一样的古代咒术师像宿傩一样复活，且让日本拥有咒力的普通人也全部觉醒成为咒术师，并释放了无数古代咒灵开始在日本大规模袭击人类，带着被封印的五条悟和里梅趁机离开。
紧接着，羂索为了让人类更好与天元同化，而在全日本设下结界，发动了让咒术师互相厮杀的死灭回游，削弱咒术师的力量并收集杀戮游戏中产生的强大咒力。就这样，现代最强咒术师五条悟成功被羂索封印，无数强大咒灵降临袭击人类世界，古代咒术师和现代咒术师全部觉醒，在死灭回游中互相杀戮，并开始了用天元同化消灭全人类的计划，剩下的行动就是去活捉天元，世界陷入危机。
而虎杖悠仁没了五条悟的庇护，咒术界高层重新开始了对虎杖悠仁的追杀。乙骨忧太因此从非洲赶回日本支援，假接下杀虎杖悠仁的任务。最后乙骨忧太和式神里香配合打倒了虎杖和胀相兄弟二人，然后在禅院直哉面前刺穿虎杖心脏，之后又用反转术式救回虎杖悠仁，从而演假死骗过了咒术界高层。虎杖和伏黑惠也去请来了高专三年级学长赌博咒术师秤金次回来支援，能使用赌博术式来不断获得力量。
而禅院直毘人在这次死后，因为曾经和甚尔的契约使得伏黑惠继承了禅院家家主，这引起了真希父亲禅院扇和哥哥禅院直哉的不满。禅院扇为了博取咒术高层信任从而撤掉伏黑惠家主之位的继承权，便砍伤了真希和真依将她俩扔入了咒灵群的房间。真希和真依姐妹俩从出生就因为没有咒力被禅院家视作不详，和甚尔一样在家族中遭受了不公正的对待。真希一直希望通过自己的努力成为禅院家家主改变这种状况，让天与咒缚者能被平等对待。（顺带一提，真希虽然和伏黑惠年龄差不多，辈分却是伏黑惠的姑姑）
最后，真依为了保护姐姐选择牺牲自己打破双胞胎双子的束缚，解除了真希的力量限制，并使用术式模仿构造了禅院甚尔曾经持有的特级咒具释魂刀。真希醒来后看到妹妹的尸体悲痛欲绝，对父母和禅院家失望的真希决定向禅院家复仇。她的天与咒缚完全觉醒实力大增成为特级水准，成为第二代天与暴君并用释魂刀屠杀了整个禅院家。这一事件也导致禅院家名存实亡，最终在五条家和加茂家的提议下，灭门的禅院家从咒术界御三家中被除名。
禅院直哉本来意外存活，却被奄奄一息的真希母亲一刀刺死。因为真希母亲在禅院家一直处于弱势地位，导致两个女儿在禅院家也没有得到应有的尊重，自己也因为禅院家的压迫无法表露对女儿的爱。真希却以为母亲从来没有爱过自己，最后杀掉了母亲。但母亲只是因为禅院家的压迫不敢表露出来，将对她们的爱深藏了起来。最后母亲为了帮女儿真希绝后患用最后一口气杀掉了禅院直哉。但直哉却因为不是被咒力杀死而变成毛毛虫形态的特级咒灵在之后重生。
之后，乙骨忧太和虎杖悠仁等人在死灭回游不停打败各种强大的咒术师，很多千年前和几百年前的古代强大咒术师也被羂索在游戏中复活，包括四百年前强者雷电咒术师“雷神”鹿紫云一、拥有咒力输出不低于虚式“茈”的石流龙、千年前日月星进队女队长乌鹭亨子、拥有两个能自主行动式神的多鲁布、特级螳螂咒灵黑沐死、千年前的女特级咒术师“万” 、千年前天使咒术师等。
乙骨忧太在仙台结界内凭借强大的实力与式神里香配合，使用自己的无限咒力和模仿术式，以一己之力经过苦战接连打败了石流龙、乌鹭亨子、多鲁布、黑沐死四个特级咒术师和咒灵。熊猫则对上了雷电咒术师鹿紫云一，被打到身体四分五裂，最后秤金次赶到用赌博之力打败了雷神鹿紫云一。真希则遇到了变成了特级咒灵再生的禅院直哉，再次和加茂宪纪用赤血操术配合与禅院直哉大战，最后击杀了禅院直哉。伏黑惠则用十种影法术召唤玉犬式神和满象式神对抗咒术师雷吉，最后展开领域嵌合暗翳庭成功击败雷吉。虎杖则对上了法律咒术师日车宽见。虎杖乙骨等人试图终结死灭回游，并找到千年前咒术师天使的容器来栖华请她解封狱门疆救回五条悟，因为她的术式是可以消灭一切术式。最终，他们成功让天使解除了狱门疆的封印，解封的五条悟为了解决后患便屠杀了整个咒术界高层。
而宿傩则让伏黑惠吞下手指转去夺舍了伏黑惠的身体获得了十种影法术，此时的宿傩已经拥有了19根手指的力量。千年前迷恋宿傩却被无情杀死的女咒术师万也夺舍伏黑惠姐姐津美纪的身体复活，他们二人都想借伏黑姐弟的身体去搞事情。之后，万再次和宿傩相遇，她向宿傩告白并表示自己对他的爱很深。万提出如果她在这场生死战中打赢且两人都存活下来，希望能和宿傩结婚。宿傩便用十种影法术召唤各种式神对战万。最终万还是败给了宿傩，连同津美纪一起再次被杀。津美纪的死让伏黑惠的灵魂从此一蹶不振，任由宿傩操控。
羂索则通过修改记忆的术式掌控了加茂家成为家主，并闯入薨星宫大战女特级咒术师九十九由基，展开领域“胎藏界”。最后九十九由基因为听从了天元的作战计划没有发挥实力而战败被杀，天元也被羂索带走。五条悟便去对战两面宿傩，乙骨忧太则去趁机一刀斩下了羂索的头颅，秤金次则去对战宿傩的部下里梅。但羂索却把他的目的在死后留给了宿傩继承，因此死灭回游没有终结。
一个古代最强咒术师一个现代最强咒术师在此相碰展开对决，一场最强之战展开。下面介绍两位最强人物的招式：
宿傩的术式为“解”和“捌”，解的攻击为普通斩击，捌则是根据咒力差和强度调整可一刀致命的斩击，其威力足以将特级咒灵瞬间切成若干块。还有火焰术式“开”在双手间凝聚烈火，威力巨大并可以造成爆炸。以及“奥义·弥虚葛笼”，可以中和别人的领域，令领域的必中效果无效化。领域为“伏魔御厨子”，以能让人自由进出领域为束缚，换取更大的攻击必中范围效果（最大可达半径200米），领域内一切有咒力的生物与非生物都会被斩至粉碎。而虎杖悠仁因为是宿傩的侄子和受肉体，拥有和宿傩一样的术式。
而五条悟的领域“无量空处”在外部表现为一个巨大的黑色球体，内部则是一瞬间无尽白光与虚无，接着整个空间变成漆黑，在被攻击者背后会出现一只极其巨大的类似于黑洞一般的眼睛。在领域内，被攻击者会什么都看不到，什么都感觉不到。灵魂与思维会瞬间接收大量的信息量被冲击，身体会因为大脑过载而呆立在原地无法动弹。可以说五条悟的领域属于控制类型，宿傩的领域属于无限造成伤害类型
宿傩展开领域“伏魔御厨子”与五条悟进行几百回合的大战，五条悟也展开了领域“无量空处”，两人进行了多次领域碰撞，并多次进入术式熔断期无法使用术式。但五条悟却多次用咒力摧毁大脑部分区域，然后发动反转术式修复大脑这种高危方法来重置术式。宿傩也用自己的办法结束了熔断期。最终五条悟的无量空处成功破除伏魔御厨子控制住宿傩。
宿傩在这时却突然使用十种影法术召唤出了最强式神魔虚罗，魔虚罗帮宿傩破除了无量空处，并开始适应五条悟的无下限术式。宿傩和五条悟都在此时无法再次展开领域，五条悟便使用术式苍与赫攻击宿傩。就在五条悟打出黑闪击晕了宿傩之时，魔虚罗成功适应无下限术式再次出现，并和五条悟展开战斗。宿傩也在此时醒来召唤大量兔子式神干扰五条悟，和魔虚罗一起对战五条悟，并使出了赤血操术的穿血击伤了五条悟的胳膊。随后宿傩融合了多种式神创造出来新的强大式神颚吐，五条悟陷入一打三的局面，并被魔虚罗斩断右臂陷入苦战。
最终五条悟成功让苍和赫相碰使出虚式茈消灭了两只最强式神并打残了宿傩，本以为最后一击会彻底打败宿傩。结果五条悟的身体却突然被宿傩的斩击一刀两断，五条悟因此死亡，现代最强咒术师五条悟战败。随后高专众人和各古代咒术师一个个开始对战残血的宿傩，包括禅院真希、最强一级咒术师日下部笃也、非洲咒术师米格尔一个个战败，雷神鹿紫云一、咒力输出第一的石流龙也被宿傩击杀，胀相也为了保护弟弟虎杖而牺牲。
最后，拥有无限咒力和模仿术式的乙骨忧太加入与宿傩的战斗，展开领域“真雁相爱”。最后乙骨也被宿傩斩断成重伤，濒死的乙骨忧太复制模仿了羂索的术式夺舍了五条悟的尸体使用无下限术式继续与宿傩大战。虽然乙骨可以使用无下限术式和虚式“茈”，却因为没有六眼导致无下限术式用起来不适，且模仿术式只能使用五分钟，五分钟后乙骨是死是活无人知晓。狗卷棘则使用咒言录音机远程协助乙骨忧太，最后五分钟过去乙骨忧太驾驶的五条悟倒下。只剩下虎杖和东堂葵两人配合对战宿傩。
随后，东堂葵为了救来趁机偷袭宿傩的天使，和天使一起被宿傩轰出战场外。只剩下虎杖悠仁单独对战两面宿傩，虎杖悠仁也在和宿傩的战斗中学会了反转术式和赤血操术，以及宿傩的术式“解”。最终虎杖悠仁想起五条悟的指导学会领域展开伏魔御厨子，将宿傩带到了自己的领域内，使用可以斩击灵魂的斩击“解”来分离伏黑惠和宿傩，伏黑惠渐渐开始被虎杖唤醒，开始帮助虎杖从宿傩体内拖住宿傩。最终对决即将展开，一场虎杖和宿傩之间的叔侄大战在领域内展开。关键时刻钉崎野蔷薇终于再次从昏迷中苏醒，对被五条悟封印的最后一根宿傩手指发动术式，对宿傩灵魂造成共鸣伤害。伏黑和钉崎一同苏醒，和虎杖共同对抗宿傩。最后虎杖一击黑闪击败宿傩，最终将伏黑惠与宿傩肉体分离。
宿傩的灵魂因脱离别人的肉体化成一只咒灵，并渐渐消散走向死亡。虎杖邀请宿傩回到自己身体，但遭到了宿傩的拒绝最后消散。而另一边和秤金次战斗的里梅感受到宿傩的失败，也随即用冰之术式自杀。就这样受肉复活的千年前的诅咒之王两面宿傩，在咒术高专一年级三人组的配合下战败而死，羂索谋划千年的死灭回游和天元同化计划彻底失败，世界再次迎来和平。
大战结束团聚后，家入硝子把五条悟留下的信转交给了伏黑惠和钉崎，告诉了他俩家人的信息，向伏黑惠承认了他父亲曾被自己给亲手杀死。随后，高专众人便前去解救夺舍了五条悟尸体的乙骨忧太。最后乙骨忧太回到了自己的身体。
